จากสถานการณ์การแพร่ระบาดของโควิด-19 โรงพยาบาลบางปะกง ได้ขยายการรักษาสู่โรงพยาบาลกักแยก (Hospital Quarantine) ณ ศูนย์ฝึกอบรมการไฟฟ้าฝ่ายผลิตแห่งประเทศไทย เพื่อดูแลผู้กักกันที่มีความเสี่ยงสูงและไม่สามารถกักตัวที่บ้านได้ ซึ่งปัจจุบันมียอดสะสม 616 คน นอกจากนี้ได้รับผิดชอบดูแลป่วยโควิด-19 กลุ่มสีเขียว ภายในศูนย์พักคอยใต้ร่มพระบารมีจังหวัดฉะเชิงเทรา (Community Isolation) ณ แขวงการก่อสร้างทางหลวงหมายเลข 3 ส่งผลให้อุปกรณ์ทางการแพทย์หลายรายการไม่เพียงพอต่อการดูแลผู้ป่วย